Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

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Length 899 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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