Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms