Protein–RNA interactions for Protein: A6NHN6

NPIPB15, Nuclear pore complex-interacting protein family member B15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB15A6NHN6 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB15A6NHN6 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB15A6NHN6 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB15A6NHN6 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB15A6NHN6 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB15A6NHN6 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB15A6NHN6 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB15A6NHN6 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB15A6NHN6 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB15A6NHN6 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms