Protein–RNA interactions for Protein: A6NHN0

OTOL1, Otolin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOL1A6NHN0 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
OTOL1A6NHN0 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms