Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms