Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.4 ms