Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD8

UBE2T, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 T, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2TQ9NPD8 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms