Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYP4F12Q9HCS2 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms