Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms