Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAT0

ROPN1, Ropporin-1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1Q9HAT0 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1Q9HAT0 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1Q9HAT0 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms