Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K1

SLC39A8, Zinc transporter ZIP8, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A8Q9C0K1 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC39A8Q9C0K1 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms