Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM31Q9BZY9 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM31Q9BZY9 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM31Q9BZY9 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM31Q9BZY9 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM31Q9BZY9 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM31Q9BZY9 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM31Q9BZY9 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms