Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms