Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ4

SLC25A39, Solute carrier family 25 member 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A39Q9BZJ4 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SLC25A39Q9BZJ4 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms