Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TDRD1Q9BXT4 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms