Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
BRIP1Q9BX63 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms