Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RIOK2Q9BVS4 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms