Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LGMNQ99538 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms