Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
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