Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms