Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 MGA-212ENST00000619521 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms