Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms