Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC10A4Q96EP9 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms