Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTP4Q96DX8 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTP4Q96DX8 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms