Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUB2Q96DC9 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms