Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC8

ECHDC3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3Q96DC8 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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