Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

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Length 71 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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SPTSSAQ969W0 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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SPTSSAQ969W0 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
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SPTSSAQ969W0 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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