Protein–RNA interactions for Protein: Q969S8

HDAC10, Histone deacetylase 10, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC10Q969S8 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HDAC10Q969S8 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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HDAC10Q969S8 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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HDAC10Q969S8 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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HDAC10Q969S8 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC10Q969S8 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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