Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms