Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2A3Q93084 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2A3Q93084 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2A3Q93084 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2A3Q93084 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2A3Q93084 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2A3Q93084 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2A3Q93084 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2A3Q93084 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2A3Q93084 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2A3Q93084 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2A3Q93084 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2A3Q93084 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2A3Q93084 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2A3Q93084 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2A3Q93084 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2A3Q93084 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP2A3Q93084 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP2A3Q93084 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP2A3Q93084 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP2A3Q93084 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP2A3Q93084 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP2A3Q93084 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP2A3Q93084 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP2A3Q93084 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP2A3Q93084 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP2A3Q93084 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP2A3Q93084 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP2A3Q93084 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP2A3Q93084 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP2A3Q93084 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP2A3Q93084 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP2A3Q93084 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP2A3Q93084 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP2A3Q93084 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP2A3Q93084 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP2A3Q93084 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP2A3Q93084 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP2A3Q93084 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP2A3Q93084 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP2A3Q93084 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP2A3Q93084 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP2A3Q93084 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP2A3Q93084 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP2A3Q93084 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP2A3Q93084 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP2A3Q93084 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP2A3Q93084 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP2A3Q93084 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP2A3Q93084 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP2A3Q93084 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP2A3Q93084 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP2A3Q93084 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP2A3Q93084 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP2A3Q93084 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP2A3Q93084 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP2A3Q93084 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP2A3Q93084 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP2A3Q93084 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP2A3Q93084 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP2A3Q93084 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP2A3Q93084 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP2A3Q93084 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP2A3Q93084 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP2A3Q93084 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP2A3Q93084 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP2A3Q93084 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP2A3Q93084 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP2A3Q93084 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP2A3Q93084 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP2A3Q93084 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP2A3Q93084 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP2A3Q93084 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP2A3Q93084 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP2A3Q93084 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP2A3Q93084 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP2A3Q93084 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP2A3Q93084 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP2A3Q93084 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP2A3Q93084 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP2A3Q93084 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP2A3Q93084 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP2A3Q93084 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP2A3Q93084 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP2A3Q93084 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP2A3Q93084 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP2A3Q93084 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP2A3Q93084 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP2A3Q93084 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP2A3Q93084 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP2A3Q93084 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP2A3Q93084 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP2A3Q93084 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP2A3Q93084 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP2A3Q93084 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP2A3Q93084 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP2A3Q93084 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP2A3Q93084 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP2A3Q93084 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP2A3Q93084 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms