Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TOPBP1Q92547 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms