Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTTNBP2Q8WZ74 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CTTNBP2Q8WZ74 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CTTNBP2Q8WZ74 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CTTNBP2Q8WZ74 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CTTNBP2Q8WZ74 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CTTNBP2Q8WZ74 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CTTNBP2Q8WZ74 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTTNBP2Q8WZ74 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTTNBP2Q8WZ74 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CTTNBP2Q8WZ74 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTTNBP2Q8WZ74 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTTNBP2Q8WZ74 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CTTNBP2Q8WZ74 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTTNBP2Q8WZ74 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTTNBP2Q8WZ74 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTTNBP2Q8WZ74 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CTTNBP2Q8WZ74 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTTNBP2Q8WZ74 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms