Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms