Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms