Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC50Q8IVM0 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms