Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC84Q86UT8 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms