Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDZD4Q76G19 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms