Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 USP17L7-201ENST00000530447 2022 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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LINC00299Q6ZSB3 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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LINC00299Q6ZSB3 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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LINC00299Q6ZSB3 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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LINC00299Q6ZSB3 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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LINC00299Q6ZSB3 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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LINC00299Q6ZSB3 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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LINC00299Q6ZSB3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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LINC00299Q6ZSB3 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
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LINC00299Q6ZSB3 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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LINC00299Q6ZSB3 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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LINC00299Q6ZSB3 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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LINC00299Q6ZSB3 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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