Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 ATL2-204ENST00000406122 2864 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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