Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms