Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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