Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
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COL5A1-AS1Q5SY13 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
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COL5A1-AS1Q5SY13 SPTY2D1-201ENST00000336349 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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COL5A1-AS1Q5SY13 SPATA2-201ENST00000289431 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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COL5A1-AS1Q5SY13 KDM2A-210ENST00000529006 6967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 SGK1-220ENST00000524929 2594 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 XRCC3-202ENST00000553264 3018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 RP1-207ENST00000637698 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 HJURP-202ENST00000411486 3187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 PSME3-217ENST00000622892 3183 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 POM121L9P-201ENST00000414583 5018 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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COL5A1-AS1Q5SY13 CDC6-201ENST00000209728 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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COL5A1-AS1Q5SY13 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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