Protein–RNA interactions for Protein: Q5FBB7

SGO1, Shugoshin 1, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SGO1Q5FBB7 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGO1Q5FBB7 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGO1Q5FBB7 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGO1Q5FBB7 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SGO1Q5FBB7 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SGO1Q5FBB7 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGO1Q5FBB7 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGO1Q5FBB7 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SGO1Q5FBB7 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SGO1Q5FBB7 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SGO1Q5FBB7 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGO1Q5FBB7 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SGO1Q5FBB7 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGO1Q5FBB7 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SGO1Q5FBB7 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SGO1Q5FBB7 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGO1Q5FBB7 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SGO1Q5FBB7 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SGO1Q5FBB7 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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SGO1Q5FBB7 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGO1Q5FBB7 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGO1Q5FBB7 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGO1Q5FBB7 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGO1Q5FBB7 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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