Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP6Q16828 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms