Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

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Length 640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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PCK2Q16822 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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PCK2Q16822 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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PCK2Q16822 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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PCK2Q16822 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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PCK2Q16822 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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PCK2Q16822 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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PCK2Q16822 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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PCK2Q16822 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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PCK2Q16822 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms