Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
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ECM1Q16610 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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ECM1Q16610 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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ECM1Q16610 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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ECM1Q16610 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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