Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FXNQ16595 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FXNQ16595 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FXNQ16595 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FXNQ16595 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FXNQ16595 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FXNQ16595 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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FXNQ16595 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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FXNQ16595 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FXNQ16595 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FXNQ16595 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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FXNQ16595 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FXNQ16595 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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FXNQ16595 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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FXNQ16595 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FXNQ16595 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FXNQ16595 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FXNQ16595 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FXNQ16595 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FXNQ16595 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FXNQ16595 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
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FXNQ16595 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FXNQ16595 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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FXNQ16595 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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FXNQ16595 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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FXNQ16595 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FXNQ16595 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
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FXNQ16595 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FXNQ16595 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FXNQ16595 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
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FXNQ16595 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FXNQ16595 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FXNQ16595 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FXNQ16595 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FXNQ16595 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FXNQ16595 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FXNQ16595 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FXNQ16595 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
FXNQ16595 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
FXNQ16595 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FXNQ16595 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
FXNQ16595 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
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