Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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CNGA3Q16281 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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CNGA3Q16281 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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CNGA3Q16281 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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CNGA3Q16281 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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CNGA3Q16281 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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