Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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