Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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